Ja bym zaproponował wkleic tu info o zapchanym RAM.
Stawiam na to, że:
tuxish-ESI88-Box:~# free
total used free shared buffers cached
Mem: 117764 71376 46388 0 6960 12268
-/+ buffers/cache: 52148 65616
Swap: 0 0 0
tuxish-ESI88-Box:~#
sekcja buffres jest duża, a to oznacza, że jak system zapragnie więcej ramu to zmniejszy buffers.
Linux to nie Windows. Inaczej zarządza pamięcią RAM.
Oczywiście strzelam w ciemno :)